Vi khuẩn có lợi chiếm ưu thế so với vi khuẩn có hại trong một cơ thể khỏe mạnh. Vi khuẩn có lợi ngoài việc khống chế những vi khuẩn có hại còn giúp kích thích cơ thể sản sinh ra những kháng thể và tăng cường hệ miễn dịch. Những yếu tố này giúp cơ thể khỏe mạnh.